diff --git a/.blueprint/manifest.yaml b/.blueprint/manifest.yaml
index 8bb8ce9..7d6617f 100644
--- a/.blueprint/manifest.yaml
+++ b/.blueprint/manifest.yaml
@@ -440,10 +440,10 @@ modules:
   - id: mcp-single-server
     name: MCP 单一服务器化
     area: backend
-    status: in_progress
-    progress: 89
+    status: done
+    progress: 100
     updated: 2026-10-03
-    note: "T1-T6 全部完成并端到端终验（2026-07-06）：单一 lian-jing 服务器上线，~/.claude.json 12 条旧注册清零，3 项目抽查新格式通过，旧路由 404。T4 暴露并修复 git-bash 硬编码存量 bug（0d1427f）。遗留：同路径重复登记待清理（见模块 done_note）。2026-10-03 开 U1-U3 清理：删除登记只清本项目托管条目、沉默项目统计去并集、2c5b54ef 并入 dev-manager-tauri"
+    note: "T1-T6 全部完成并端到端终验（2026-07-06）：单一 lian-jing 服务器上线，~/.claude.json 12 条旧注册清零，3 项目抽查新格式通过，旧路由 404。T4 暴露并修复 git-bash 硬编码存量 bug（0d1427f）。遗留的同路径重复登记已于 2026-10-03 由 U1-U3 清理完毕：删除登记只清本项目托管条目、沉默项目统计去并集、2c5b54ef 并入 dev-manager-tauri 后删除登记（beast-mode 同类重复未处理，见统筹文档后续队列）"
     position: [1750, 500]
 
 
diff --git a/.blueprint/modules/mcp-single-server.md b/.blueprint/modules/mcp-single-server.md
index 4c8b5bd..84df5de 100644
--- a/.blueprint/modules/mcp-single-server.md
+++ b/.blueprint/modules/mcp-single-server.md
@@ -128,10 +128,11 @@
 - done_note: 2026-10-03 完成。新增 `silent_projects_counts_each_commit_once_under_duplicate_registration`（旧 SQL 在同一夹具上得 [3, 5]，新 SQL 得 [2, 3]）与 `diagnostics_inject_label_shows_name_and_flags_unregistered`；`cargo test` 全量 303 通过。
 - 为什么：`pw.id = cm.project_id OR pw.win_path = bb.project_path` 在同路径多登记时让一条 commit 同时匹配多个 workspace；注入状态只打 ID，人读不出 `d248554e-…` 是哪个项目。
 
-### 🔵 U3. 存量合并：2c5b54ef 并入 dev-manager-tauri 后删除登记
-- status: in_progress
+### ✅ U3. 存量合并：2c5b54ef 并入 dev-manager-tauri 后删除登记
+- status: done
 - complexity: S
 - files: （运维操作，无代码改动）
 - acceptance: "agent_verify: [只读 SQL] project_workspaces 中 win_path=E:\code-project\dev-manager-tauri 仅 1 行；gitea_repos 指向 lanrtop/dev-manager-tauri 仅 1 行；commit_metrics/project_notes/pr_events 无 2c5b54ef 残留；[MCP] get_diagnostics 覆盖率 dev-manager-tauri 仅 1 行；verify_onboarding(dev-manager-tauri) 与操作前状态一致；主仓库 git diff .codex/config.toml 为空"
 - 步骤：① 先解绑 2c5b54ef 的 Gitea（gitea_unlink_repo，删重复 webhook，停双采集）② 在线备份 DB ③ 单事务迁移：commit_metrics / project_notes / 独有 pr_events / 待办改挂规范 ID，重复 pr_events 与 UUID 快照、文档新鲜度缓存删除，space / repo 绑定 / 产品组成员 / profile 空字段补给规范 ID ④ unregister_project(2c5b54ef) → 立即 inject_mcp(dev-manager-tauri) 补回（运行中的旧二进制尚无 U1 修复）⑤ backfill_notes_archive ⑥ 删空产品组 d669f693
+- done_note: 2026-10-03 完成。用户执行合并脚本（运行中 DB 写入被自动模式安全分类器拦截，按约定交用户执行）：commit 258 条、笔记 20 条、待办 1 条改挂规范 ID，PR 事件删重复 58 条、迁独有 3 条，UUID 快照 83 条与文档新鲜度缓存删除，space / repo 绑定 / 产品组成员 / profile 空字段补给规范 ID，删空产品组 d669f693，删 UUID 的 gitea_repos 行（该绑定无 webhook、无凭证引用，与 gitea_unlink_repo 等价）。随后经全局 MCP 执行 unregister_project(2c5b54ef) → inject_mcp(dev-manager-tauri) → backfill_notes_archive（预演确认只改写主仓库档案 27→34 条，其余项目档案不变）。验收：全库无 2c5b54ef 残留；同路径登记 1 行；Gitea 绑定 1 行；get_diagnostics 覆盖率 dev-manager-tauri 仅 1 行（176 条 commit）；verify_onboarding 11/13 与操作前一致（唯一变化：近 30 天 commit 109→176）。**验收改动声明**：「主仓库 git diff .codex/config.toml 为空」未满足——差异是重注入把 9-23 旧格式块升级为带 `http_headers_helper` 的当前格式（digest = sha256(project_id)，代码注明可入库），不是删除连带破坏；且 PR #34 已先合并重编译，unregister 本就不再动规范 ID 的块。该行留作主仓库未提交改动由用户决定是否提交。更正：双采集来自 Gitea 轮询遍历两行绑定，不是两个 webhook（两行 webhook_id 均为空）。遗留发现：4 条 dev-manager-tauri 旧笔记在 DB 中不是 UTF-8，backfill 的 filter_map 静默跳过（档案与回报计数都不含）。备份：%APPDATA%\com.yangzhixiang.dev-manager-tauri\dev-manager.backup-20261003-before-dedupe.db
 - 不做：「登记时拒绝同路径」归 agent-client-parity P8f（已规划含重复登记拒绝），此处不重复实现；beast-mode 同类重复（beast-mode / 940dfbb4，无 Gitea 绑定、近 30 天无活动）本卡不处理。