diff --git a/docs/ai-context/project-context.yaml b/docs/ai-context/project-context.yaml
index 0b615b3..08a3cfb 100644
--- a/docs/ai-context/project-context.yaml
+++ b/docs/ai-context/project-context.yaml
@@ -6,7 +6,7 @@ contracts:
   - label: API 接口（Axum）
     paths:
       - "src-tauri/src/mcp_server.rs"
-    doc: "MCP 仅监听 127.0.0.1；新项目使用 /mcp/projects/<project_id> scoped route，连接 scope 拒绝跨项目参数和全局管理写工具。scoped route 只服务已登记项目，未知 project_id 返回 404（数据库不可用同样拒绝）。各客户端经 %LOCALAPPDATA%/lian-jing/bin/lianjing-mcp-header.cmd 稳定入口取认证头（炼境每次启动指向当前 exe）：Codex 写项目 .codex/config.toml，Claude 写 ~/.claude.json 的 local 条目（优先于 user 级全局），DSH 写 ~/.dsh/cordis.patch.yml 托管块（内嵌炼境登记的「项目根目录→project_id」白名单，!!js 从启动目录向上精确匹配根目录才选项目地址并取认证，任意目录里的 context.json 不作授权依据；未命中回退全局；项目增删与端口变更时重写）。Claude local 条目与 DSH 块只替换炼境托管的条目，手写同名配置不覆盖；移除项目时一并清理。旧 /mcp 只作兼容迁移。read_project_dev_variable 与 read_project_test_account 是两种有界开发值读取：仅 scoped 路由、匹配项目的本机 bearer 认证后单项读取；认证失败在 dispatch 前拒绝。路由变更需同步 Agent 按钮体系文档。"
+    doc: "MCP 仅监听 127.0.0.1；新项目使用 /mcp/projects/<project_id> scoped route，连接 scope 拒绝跨项目参数和全局管理写工具。scoped route 只服务已登记项目，未知 project_id 返回 404（数据库不可用同样拒绝）。各客户端经 %LOCALAPPDATA%/lian-jing/bin/lianjing-mcp-header.cmd 稳定入口取认证头（炼境每次启动指向当前 exe）：Codex 写项目 .codex/config.toml，Claude 写 ~/.claude.json 的 local 条目（优先于 user 级全局；直接编辑该文件中本项目键下的 mcpServers.lian-jing，不经 claude CLI、不依赖项目目录存在，项目键用真实长路径；原子替换写入），DSH 写 ~/.dsh/cordis.patch.yml 托管块（内嵌炼境登记的「项目根目录→project_id」白名单，!!js 从启动目录向上精确匹配根目录才选项目地址并取认证，任意目录里的 context.json 不作授权依据；未命中回退全局；项目增删与端口变更时重写）。Claude local 条目与 DSH 块只替换炼境托管的条目，手写同名配置不覆盖；移除项目时一并清理。旧 /mcp 只作兼容迁移。read_project_dev_variable 与 read_project_test_account 是两种有界开发值读取：仅 scoped 路由、匹配项目的本机 bearer 认证后单项读取；认证失败在 dispatch 前拒绝。路由变更需同步 Agent 按钮体系文档。"
 
   - label: MCP 工具接口
     paths:
diff --git a/src-tauri/src/commands/projects.rs b/src-tauri/src/commands/projects.rs
index d7a1d43..cbedfc1 100644
--- a/src-tauri/src/commands/projects.rs
+++ b/src-tauri/src/commands/projects.rs
@@ -304,11 +304,11 @@ pub fn update_project(id: String, input: UpdateProjectInput) -> Result<(), Strin
 
     // 根目录变化：Claude local 条目按目录挂载、DSH 白名单按根目录匹配，都要迁移到新根。
     // 会调用 claude CLI，放到后台线程，避免同步命令卡住界面。
-    if let Some(old_root) = old_root {
+    if root_may_change {
         let new_root = crate::mcp_inject::project_root_with_conn(&conn, &id).ok();
-        if new_root.as_ref() != Some(&old_root) {
+        if crate::mcp_inject::project_root_changed(old_root.as_ref(), new_root.as_ref()) {
             drop(conn);
-            std::thread::spawn(move || crate::mcp_inject::on_project_root_changed(&id, Some(old_root)));
+            std::thread::spawn(move || crate::mcp_inject::on_project_root_changed(&id, old_root));
         }
     }
 
diff --git a/src-tauri/src/mcp_inject.rs b/src-tauri/src/mcp_inject.rs
index bbad37c..8233eef 100644
--- a/src-tauri/src/mcp_inject.rs
+++ b/src-tauri/src/mcp_inject.rs
@@ -362,19 +362,18 @@ fn global_log_context() -> String {
 }
 
 /// Claude Code local scope 条目：项目专用地址 + 稳定 helper。local 优先于 user 级全局注册且不进仓库。
-fn claude_local_server_json(server_url: &str, header_helper: &str) -> String {
+fn claude_local_server_entry(server_url: &str, header_helper: &str) -> Value {
     json!({
         "type": "http",
         "url": server_url,
         "headersHelper": header_helper,
     })
-    .to_string()
 }
 
 #[derive(Debug, PartialEq)]
 enum ClaudeLocalEntry {
     Absent,
-    /// 炼境写入的条目（项目路由 + 稳定 helper），可安全替换或删除；附原值供失败回滚。
+    /// 炼境写入的条目（项目路由 + 稳定 helper），可安全替换或删除。
     Managed(Value),
     /// 用户手写的同名条目：炼境不覆盖、不删除。
     Manual,
@@ -413,128 +412,166 @@ fn classify_claude_local_entry(claude_json: &Value, root: &std::path::Path) -> C
     }
 }
 
-fn read_claude_user_config() -> Option<Value> {
-    let home = std::env::var("USERPROFILE").ok()?;
-    let text = std::fs::read_to_string(PathBuf::from(home).join(".claude.json")).ok()?;
-    serde_json::from_str(&text).ok()
+#[derive(Debug, PartialEq)]
+enum ClaudeLocalOutcome {
+    Unchanged,
+    Registered,
+    Removed,
+    KeptManual,
 }
 
-fn run_claude_cli(
-    claude_bin: &str,
-    git_bash: &str,
+/// 纯函数：把期望状态写进 ~/.claude.json 的配置对象。只动本项目条目下的 mcpServers.lian-jing，
+/// 项目对象里 Claude 自己维护的其他字段与其他 server 原样保留；手写条目不碰。
+fn apply_claude_local(
+    config: &mut Value,
     root: &std::path::Path,
-    args: &[&str],
-) -> Result<(), String> {
-    let out = crate::silent_cmd(claude_bin)
-        .current_dir(root)
-        .args(args)
-        .env("CLAUDE_CODE_GIT_BASH_PATH", git_bash)
-        .output()
-        .map_err(|error| format!("执行 claude CLI 失败: {error}"))?;
-    if out.status.success() {
-        Ok(())
+    desired: Option<Value>,
+) -> Result<ClaudeLocalOutcome, String> {
+    match (classify_claude_local_entry(config, root), &desired) {
+        (ClaudeLocalEntry::Manual, _) => return Ok(ClaudeLocalOutcome::KeptManual),
+        (ClaudeLocalEntry::Absent, None) => return Ok(ClaudeLocalOutcome::Unchanged),
+        (ClaudeLocalEntry::Managed(current), Some(entry)) if &current == entry => {
+            return Ok(ClaudeLocalOutcome::Unchanged)
+        }
+        _ => {}
+    }
+    let wanted = normalize_root_key(&root.display().to_string());
+    let projects = config
+        .as_object_mut()
+        .ok_or("~/.claude.json 顶层不是 JSON 对象")?
+        .entry("projects")
+        .or_insert_with(|| json!({}))
+        .as_object_mut()
+        .ok_or("~/.claude.json 的 projects 不是 JSON 对象")?;
+    // 复用 Claude 已记录的键（大小写、分隔符以它为准），没有才按它的惯例（正斜杠）新建
+    let key = projects
+        .keys()
+        .find(|key| normalize_root_key(key) == wanted)
+        .cloned()
+        .unwrap_or_else(|| root.display().to_string().replace('\\', "/"));
+    match desired {
+        Some(entry) => {
+            projects
+                .entry(key)
+                .or_insert_with(|| json!({}))
+                .as_object_mut()
+                .ok_or("~/.claude.json 的项目条目不是 JSON 对象")?
+                .entry("mcpServers")
+                .or_insert_with(|| json!({}))
+                .as_object_mut()
+                .ok_or("~/.claude.json 的 mcpServers 不是 JSON 对象")?
+                .insert(MCP_KEY.to_string(), entry);
+            Ok(ClaudeLocalOutcome::Registered)
+        }
+        None => {
+            if let Some(servers) = projects
+                .get_mut(&key)
+                .and_then(|project| project.get_mut("mcpServers"))
+                .and_then(Value::as_object_mut)
+            {
+                servers.remove(MCP_KEY);
+            }
+            Ok(ClaudeLocalOutcome::Removed)
+        }
+    }
+}
+
+/// 同目录临时文件 + 重命名替换：读者只会看到完整的旧文件或新文件。目标被短暂占用时重试几次。
+fn write_file_atomic(path: &std::path::Path, content: &str) -> Result<(), String> {
+    let tmp = path.with_file_name(format!(
+        "{}.lianjing-tmp",
+        path.file_name().and_then(|name| name.to_str()).unwrap_or("config")
+    ));
+    std::fs::write(&tmp, content).map_err(|error| format!("写临时文件失败: {error}"))?;
+    let mut last_error = None;
+    for _ in 0..5 {
+        match std::fs::rename(&tmp, path) {
+            Ok(()) => return Ok(()),
+            Err(error) => {
+                last_error = Some(error);
+                std::thread::sleep(std::time::Duration::from_millis(50));
+            }
+        }
+    }
+    let _ = std::fs::remove_file(&tmp);
+    Err(format!("替换文件失败: {}", last_error.map(|e| e.to_string()).unwrap_or_default()))
+}
+
+/// Claude 以真实长路径记录项目（8.3 短名与大小写都以文件系统为准；2026-10-01 实测短路径键不会被识别）。
+/// 目录存在时规范化为长路径（去掉 \\?\ 前缀），不存在（已移动或删除）时原样使用。
+fn claude_project_path(root: &std::path::Path) -> PathBuf {
+    let Ok(canonical) = std::fs::canonicalize(root) else {
+        return root.to_path_buf();
+    };
+    let text = canonical.display().to_string();
+    if let Some(rest) = text.strip_prefix(r"\\?\UNC\") {
+        PathBuf::from(format!(r"\\{rest}"))
+    } else if let Some(rest) = text.strip_prefix(r"\\?\") {
+        PathBuf::from(rest)
     } else {
-        Err(format!(
-            "{}{}",
-            String::from_utf8_lossy(&out.stdout),
-            String::from_utf8_lossy(&out.stderr)
-        ))
+        canonical
     }
 }
 
 /// 客户端侧同步（Claude local、DSH 托管块）的日志单独归类：不覆盖诊断里每个项目的「最后一次注入结果」。
 const CLIENT_SYNC_LOG: &str = "mcp_client_sync";
 
-type ClaudeSyncJob = (String, PathBuf, Option<(String, String)>);
-static CLAUDE_SYNC_QUEUE: std::sync::OnceLock<std::sync::Mutex<std::sync::mpsc::Sender<ClaudeSyncJob>>> =
-    std::sync::OnceLock::new();
-
-/// 所有 Claude local 同步投递到同一个后台线程，按提交顺序串行执行：避免多个 claude CLI 并发
-/// 读改写 ~/.claude.json，也保证「注入后立刻移除」时移除不会被更早的注册越过。调用方不阻塞。
-fn enqueue_claude_sync(project_id: &str, root: PathBuf, desired: Option<(String, String)>) {
-    let queue = CLAUDE_SYNC_QUEUE.get_or_init(|| {
-        let (sender, receiver) = std::sync::mpsc::channel::<ClaudeSyncJob>();
-        std::thread::spawn(move || {
-            for (project_id, root, desired) in receiver {
-                sync_claude_local(&project_id, &root, desired);
-            }
-        });
-        std::sync::Mutex::new(sender)
-    });
-    if let Ok(sender) = queue.lock() {
-        let _ = sender.send((project_id.to_string(), root, desired));
-    }
-}
-
 /// 让 Claude 的 local 条目与期望一致：desired=Some 时注册/刷新，None 时只删除炼境托管的条目。
-/// 手写条目一律不碰；替换失败时用原值回滚。best-effort，结果只记日志。只应经 enqueue_claude_sync 调用。
+/// 直接编辑 ~/.claude.json（Claude Code 文档列出的配置方式之一），不经 claude CLI：不依赖项目目录
+/// 存在（目录已删除或移动也能清理旧条目）、不起子进程、毫秒级完成，因此可在调用方同步执行。
+/// Claude 自己也会写这个文件，读改写窗口压到最小（紧挨写入前读取 + 原子替换）。best-effort，只记日志。
+/// 调用方须持有 mcp_op_lock，保证本进程内对该文件的读改写串行。
 fn sync_claude_local(project_id: &str, root: &std::path::Path, desired: Option<(String, String)>) {
-    let context = inject_log_context(project_id, "claude");
-    let state = read_claude_user_config()
-        .map(|config| classify_claude_local_entry(&config, root))
-        .unwrap_or(ClaudeLocalEntry::Absent);
-    if matches!((&state, &desired), (ClaudeLocalEntry::Absent, None)) {
+    let Ok(home) = std::env::var("USERPROFILE") else {
+        return;
+    };
+    let path = PathBuf::from(home).join(".claude.json");
+    if !path.is_file() {
+        // 本机从未运行过 Claude Code：不替它创建配置
         return;
     }
-    let (Some(claude_bin), Some(git_bash)) = (find_claude_bin(), find_git_bash()) else {
-        db::log_event(
-            CLIENT_SYNC_LOG,
-            "warn",
-            "claude CLI 或 git-bash 未找到，跳过 Claude 项目级 MCP 同步",
-            Some(&context),
-        );
-        return;
-    };
-    let remove_args = ["mcp", "remove", MCP_KEY, "--scope", "local"];
-    let outcome = match (state, desired) {
-        (ClaudeLocalEntry::Manual, _) => {
-            Ok("本项目已有手写的 lian-jing local 条目，炼境不覆盖".to_string())
+    let root = claude_project_path(root);
+    let root = root.as_path();
+    let result = (|| -> Result<ClaudeLocalOutcome, String> {
+        let text = std::fs::read_to_string(&path).map_err(|error| format!("读取失败: {error}"))?;
+        let mut config: Value =
+            serde_json::from_str(&text).map_err(|error| format!("解析失败，炼境不写入: {error}"))?;
+        let entry = desired.map(|(url, helper)| claude_local_server_entry(&url, &helper));
+        let outcome = apply_claude_local(&mut config, root, entry)?;
+        if matches!(outcome, ClaudeLocalOutcome::Registered | ClaudeLocalOutcome::Removed) {
+            let content = serde_json::to_string_pretty(&config).map_err(|error| error.to_string())?;
+            write_file_atomic(&path, &content)?;
         }
-        (ClaudeLocalEntry::Absent, None) => return,
-        (ClaudeLocalEntry::Managed(_), None) => {
-            run_claude_cli(&claude_bin, &git_bash, root, &remove_args)
-                .map(|_| "Claude 项目级 MCP 条目已移除".to_string())
-        }
-        (previous, Some((server_url, header_helper))) => {
-            let payload = claude_local_server_json(&server_url, &header_helper);
-            let add_args = ["mcp", "add-json", MCP_KEY, payload.as_str(), "--scope", "local"];
-            let registered = if let ClaudeLocalEntry::Managed(old) = &previous {
-                if let Err(error) = run_claude_cli(&claude_bin, &git_bash, root, &remove_args) {
-                    db::log_event(
-                        CLIENT_SYNC_LOG,
-                        "warn",
-                        &format!("Claude 项目级 MCP 旧条目移除失败: {error}"),
-                        Some(&context),
-                    );
-                    return;
-                }
-                run_claude_cli(&claude_bin, &git_bash, root, &add_args).or_else(|error| {
-                    let restore = old.to_string();
-                    let _ = run_claude_cli(
-                        &claude_bin,
-                        &git_bash,
-                        root,
-                        &["mcp", "add-json", MCP_KEY, restore.as_str(), "--scope", "local"],
-                    );
-                    Err(format!("{error}（已尝试恢复原条目）"))
-                })
-            } else {
-                run_claude_cli(&claude_bin, &git_bash, root, &add_args)
+        Ok(outcome)
+    })();
+    let context = inject_log_context(project_id, "claude");
+    match result {
+        Ok(ClaudeLocalOutcome::Unchanged) => {}
+        Ok(outcome) => {
+            let message = match outcome {
+                ClaudeLocalOutcome::Registered => "Claude 项目级 MCP 条目已写入",
+                ClaudeLocalOutcome::Removed => "Claude 项目级 MCP 条目已移除",
+                _ => "本项目已有手写的 lian-jing local 条目，炼境不覆盖",
             };
-            registered.map(|_| "Claude 项目级 MCP 注册成功".to_string())
+            db::log_event(CLIENT_SYNC_LOG, "info", message, Some(&context));
         }
-    };
-    match outcome {
-        Ok(message) => db::log_event(CLIENT_SYNC_LOG, "info", &message, Some(&context)),
         Err(error) => db::log_event(
             CLIENT_SYNC_LOG,
             "warn",
-            &format!("Claude 项目级 MCP 同步失败: {error}"),
+            &format!("Claude 项目级 MCP 同步失败（~/.claude.json）: {error}"),
             Some(&context),
         ),
     }
 }
 
+/// 进程内所有「炼境 MCP 接入」写操作（注入、移除、根目录迁移）串行执行：
+/// 检查 token → 写项目文件 → 写客户端配置作为一个整体，不与其他接入操作交错。
+static MCP_OP_LOCK: std::sync::Mutex<()> = std::sync::Mutex::new(());
+
+fn mcp_op_lock() -> std::sync::MutexGuard<'static, ()> {
+    MCP_OP_LOCK.lock().unwrap_or_else(|poisoned| poisoned.into_inner())
+}
+
 // ── DSH 机器级配置托管块 ──────────────────────────────────────────────────────
 // DSH 配置无法按项目拆分，但 !!js 在加载时以启动目录求值。项目身份只认炼境登记表：托管块内嵌
 // 「已登记项目根目录 → project_id」白名单（非秘密），从启动目录向上精确匹配根目录才连项目专用地址
@@ -761,8 +798,14 @@ pub fn ensure_dsh_patch(
     Ok(true)
 }
 
+/// DSH 补丁文件的读-算-写在本进程内串行（启动线程与注入/移除可能同时刷新）。
+static DSH_PATCH_LOCK: std::sync::Mutex<()> = std::sync::Mutex::new(());
+
 /// 刷新 DSH 托管块的 best-effort 包装：失败只记日志。
 pub fn refresh_dsh_patch(exclude: Option<&str>) {
+    let _guard = DSH_PATCH_LOCK
+        .lock()
+        .unwrap_or_else(|poisoned| poisoned.into_inner());
     let result = db::pool()
         .get()
         .map_err(|error| error.to_string())
@@ -948,11 +991,13 @@ fn remove_codex_mcp_config(path: &PathBuf) -> Result<(), String> {
 /// 向项目的 .claude/settings.json 注入单一 lian-jing MCP 配置，
 /// 并清理旧组级 key（迁移内建于重注入）
 pub fn inject_project_mcp(project_id: &str) -> Result<(), String> {
-    inject_project_mcp_with(project_id, true)
+    let _guard = mcp_op_lock();
+    inject_project_mcp_locked(project_id, true)
 }
 
-/// refresh_dsh=false 供批量重注入使用：逐项目跳过 DSH 刷新，由调用方在末尾统一刷新一次。
-fn inject_project_mcp_with(project_id: &str, refresh_dsh: bool) -> Result<(), String> {
+/// 调用方须持有 mcp_op_lock。refresh_dsh=false 供批量重注入使用：逐项目跳过 DSH 刷新，
+/// 由调用方在末尾统一刷新一次。
+fn inject_project_mcp_locked(project_id: &str, refresh_dsh: bool) -> Result<(), String> {
     let port = crate::mcp_server::read_port();
     let server_url = crate::mcp_server::scoped_mcp_url(port, project_id);
     let digest = crate::credential_store::mcp_auth_digest(project_id)?;
@@ -999,8 +1044,7 @@ fn inject_project_mcp_with(project_id: &str, refresh_dsh: bool) -> Result<(), St
     try_register_globally(port);
     let root = project_root(project_id)?;
     let desired = (!project_wants_global_scope(&root)).then(|| (server_url, header_helper));
-    // claude CLI 每次调用约 1-2 秒：投递到串行后台队列，不阻塞界面，也不与其他同步竞态
-    enqueue_claude_sync(project_id, root, desired);
+    sync_claude_local(project_id, &root, desired);
     if refresh_dsh {
         refresh_dsh_patch(None);
     }
@@ -1010,13 +1054,34 @@ fn inject_project_mcp_with(project_id: &str, refresh_dsh: bool) -> Result<(), St
 /// 从项目的 .claude/settings.json 移除炼境 MCP 配置（含旧组级 key）。
 /// 调用方需自行保证项目已不属于任何产品组时才调用。
 pub fn remove_project_mcp(project_id: &str) -> Result<(), String> {
-    // 先于登记删除算出根目录并排队清理客户端侧条目：残留的 local 条目会遮蔽全局注册并指向 404 地址。
-    // 与注册共用同一串行队列，保证移除不会被更早提交的注册越过。
+    let _guard = mcp_op_lock();
+    // 先于登记删除、也先于删除本地文件夹同步清理客户端侧条目：残留的 local 条目会遮蔽全局注册并指向 404 地址。
     if let Ok(root) = project_root(project_id) {
-        enqueue_claude_sync(project_id, root, None);
+        sync_claude_local(project_id, &root, None);
     }
-    // 登记此时仍在，用 exclude 立即剔除；token 随后被删，之后的刷新也不会再把它加回白名单
+    // token 最先删：DSH 白名单剔除与根目录迁移判定都以 token 为准，后面的文件清理即使失败也不影响这一点
+    let token_removed = crate::credential_store::delete_mcp_auth_token_for_project(
+        &crate::credential_store::WindowsCredentialStore,
+        project_id,
+    );
+    // 登记此时仍在，exclude 立即剔除；token 已删，之后的刷新也不会再把它加回白名单
     refresh_dsh_patch(Some(project_id));
+    let mut errors: Vec<String> = Vec::new();
+    if let Err(error) = remove_project_files_mcp(project_id) {
+        errors.push(error);
+    }
+    if let Err(error) = token_removed {
+        errors.push(error);
+    }
+    if errors.is_empty() {
+        Ok(())
+    } else {
+        Err(errors.join("；"))
+    }
+}
+
+/// 清理项目文件中的炼境 MCP 配置（Codex 托管块与 .claude/settings.json 兼容条目）。
+fn remove_project_files_mcp(project_id: &str) -> Result<(), String> {
     remove_codex_mcp_config(&codex_config_path(project_id)?)?;
     let path = settings_path(project_id)?;
     if path.exists() {
@@ -1030,10 +1095,7 @@ pub fn remove_project_mcp(project_id: &str) -> Result<(), String> {
         }
         write_json(&path, &settings)?;
     }
-    crate::credential_store::delete_mcp_auth_token_for_project(
-        &crate::credential_store::WindowsCredentialStore,
-        project_id,
-    )
+    Ok(())
 }
 
 /// 单一服务器化一次性迁移：批量重注入所有托管项目（换新 key + 清旧 key + liangjing.json 瘦身）
@@ -1108,7 +1170,8 @@ pub fn reinject_all_mcp() -> Vec<String> {
 
     let mut errors = Vec::new();
     for project_id in project_ids {
-        if let Err(e) = inject_project_mcp_with(&project_id, false) {
+        let _guard = mcp_op_lock();
+        if let Err(e) = inject_project_mcp_locked(&project_id, false) {
             errors.push(format!("项目 {}: {}", project_id, e));
         }
     }
@@ -1117,11 +1180,14 @@ pub fn reinject_all_mcp() -> Vec<String> {
     errors
 }
 
-/// 项目根目录或平台变更后调用：排队清理旧根下炼境托管的 Claude local 条目；已接入（有 token）的项目
-/// 在新根重新注入（会刷新 DSH 白名单），未接入的只刷新白名单。会调用 claude CLI，调用方应放在后台线程。
+/// 项目根目录或平台变更后调用：清理旧根下炼境托管的 Claude local 条目（直接编辑配置，旧目录不存在也能清理）；
+/// 已接入（有 token）的项目在新根重新注入（会刷新 DSH 白名单），未接入的只刷新白名单。
+/// 重新注入会跑 claude CLI 做全局注册，调用方应放在后台线程。持锁执行：与并发的移除/删除串行，
+/// 移除先完成则 token 已不在，这里就不会再注入。
 pub fn on_project_root_changed(project_id: &str, old_root: Option<PathBuf>) {
+    let _guard = mcp_op_lock();
     if let Some(root) = old_root {
-        enqueue_claude_sync(project_id, root, None);
+        sync_claude_local(project_id, &root, None);
     }
     let injected = crate::credential_store::mcp_auth_digest(project_id)
         .and_then(|digest| {
@@ -1135,16 +1201,24 @@ pub fn on_project_root_changed(project_id: &str, old_root: Option<PathBuf>) {
         refresh_dsh_patch(None);
         return;
     }
-    if let Err(error) = inject_project_mcp(project_id) {
+    if let Err(error) = inject_project_mcp_locked(project_id, true) {
+        // 属于注入结果，归入 mcp_inject；注入中途失败可能没走到刷新，这里补一次
         db::log_event(
-            CLIENT_SYNC_LOG,
+            "mcp_inject",
             "warn",
             &format!("项目根目录变更后重新注入失败: {error}"),
             Some(&inject_log_context(project_id, "all")),
         );
+        refresh_dsh_patch(None);
     }
 }
 
+/// 纯函数：update_project 后是否需要迁移客户端配置。只要能解析出新根且与旧根不同就迁移；
+/// 旧根解析不出（例如旧路径为空）也照样迁移，只是没有旧条目要清理。
+pub(crate) fn project_root_changed(old_root: Option<&PathBuf>, new_root: Option<&PathBuf>) -> bool {
+    new_root.is_some() && new_root != old_root
+}
+
 #[cfg(test)]
 mod tests {
     use super::*;
@@ -1345,16 +1419,91 @@ mod tests {
 
     #[test]
     fn claude_local_entry_uses_scoped_url_and_shim() {
-        let entry: Value = serde_json::from_str(&claude_local_server_json(
+        let entry = claude_local_server_entry(
             "http://127.0.0.1:27190/mcp/projects/p1",
             &shim_helper_command("d1"),
-        ))
-        .unwrap();
+        );
         assert_eq!(entry["type"], "http");
         assert_eq!(entry["url"], "http://127.0.0.1:27190/mcp/projects/p1");
         assert!(entry["headersHelper"].as_str().unwrap().contains("%LOCALAPPDATA%"));
     }
 
+    #[test]
+    fn claude_local_direct_edit_touches_only_lian_jing_entry() {
+        let root = std::path::Path::new("E:\\code-project\\Demo");
+        let entry = claude_local_server_entry(
+            "http://127.0.0.1:27190/mcp/projects/p1",
+            &shim_helper_command("d1"),
+        );
+        // 已有项目键（大小写、分隔符与 root 不同）：复用该键，保留 Claude 自己的字段与其他 server
+        let mut config = json!({
+            "numStartups": 3,
+            "projects": { "e:/code-project/demo": {
+                "lastCost": 1.5,
+                "mcpServers": { "other": { "type": "stdio" } }
+            } }
+        });
+        assert_eq!(
+            apply_claude_local(&mut config, root, Some(entry.clone())).unwrap(),
+            ClaudeLocalOutcome::Registered
+        );
+        let project = &config["projects"]["e:/code-project/demo"];
+        assert_eq!(config["projects"].as_object().unwrap().len(), 1, "不新增重复键");
+        assert_eq!(project["lastCost"], 1.5);
+        assert_eq!(project["mcpServers"]["other"]["type"], "stdio");
+        assert_eq!(project["mcpServers"][MCP_KEY], entry);
+        assert_eq!(config["numStartups"], 3);
+        assert_eq!(
+            apply_claude_local(&mut config, root, Some(entry.clone())).unwrap(),
+            ClaudeLocalOutcome::Unchanged,
+            "相同条目不重写"
+        );
+
+        assert_eq!(apply_claude_local(&mut config, root, None).unwrap(), ClaudeLocalOutcome::Removed);
+        let project = &config["projects"]["e:/code-project/demo"];
+        assert!(project["mcpServers"].get(MCP_KEY).is_none());
+        assert_eq!(project["mcpServers"]["other"]["type"], "stdio", "移除只删 lian-jing");
+        assert_eq!(apply_claude_local(&mut config, root, None).unwrap(), ClaudeLocalOutcome::Unchanged);
+
+        // 尚无项目键：按 Claude 惯例（正斜杠）新建
+        let mut empty = json!({});
+        apply_claude_local(&mut empty, root, Some(entry.clone())).unwrap();
+        assert_eq!(empty["projects"]["E:/code-project/Demo"]["mcpServers"][MCP_KEY], entry);
+
+        // 手写条目：注册与移除都不碰
+        let manual = json!({ "type": "http", "url": "https://example.invalid/mcp" });
+        let mut handwritten = json!({ "projects": { "E:/code-project/Demo": { "mcpServers": { "lian-jing": manual.clone() } } } });
+        assert_eq!(
+            apply_claude_local(&mut handwritten, root, Some(entry)).unwrap(),
+            ClaudeLocalOutcome::KeptManual
+        );
+        assert_eq!(apply_claude_local(&mut handwritten, root, None).unwrap(), ClaudeLocalOutcome::KeptManual);
+        assert_eq!(handwritten["projects"]["E:/code-project/Demo"]["mcpServers"][MCP_KEY], manual);
+    }
+
+    #[test]
+    fn claude_project_path_is_long_form_without_verbatim_prefix() {
+        let dir = std::env::temp_dir().join(format!("lianjing_claude_path_{}", std::process::id()));
+        std::fs::create_dir_all(&dir).unwrap();
+        let resolved = claude_project_path(&dir).display().to_string();
+        assert!(!resolved.starts_with(r"\\?\"), "不得带 verbatim 前缀：{resolved}");
+        assert!(!resolved.contains('~'), "8.3 短名须展开为长路径：{resolved}");
+        assert!(std::path::Path::new(&resolved).is_dir());
+        let missing = std::path::Path::new("E:\\definitely\\missing\\root");
+        assert_eq!(claude_project_path(missing), missing.to_path_buf(), "不存在时原样返回");
+        let _ = std::fs::remove_dir_all(&dir);
+    }
+
+    #[test]
+    fn project_root_change_detection() {
+        let old = PathBuf::from("E:\\old");
+        let new = PathBuf::from("E:\\new");
+        assert!(project_root_changed(Some(&old), Some(&new)));
+        assert!(project_root_changed(None, Some(&new)), "旧根解析不出也要迁移");
+        assert!(!project_root_changed(Some(&old), Some(&old)));
+        assert!(!project_root_changed(Some(&old), None), "新根解析不出则不动");
+    }
+
     #[test]
     fn dsh_block_is_valid_yaml_with_registry_routing_and_shim_auth() {
         let roots = vec![